自2013年circRNA重新进入人们视野，得益于二代测序，2017年到2018年circRNA研究成果井喷式增长。近两年circRNA研究热度势头不减，发文量逐年攀升，2020年也是circRNA研究取得丰硕成果的一年，高达近3000篇。云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的测序公司，自行建立的环状RNA数据库circDB，凭借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点为客户提供优质的服务。云序积累了超过10000例环状RNA测序的经验，样本覆盖20多个物种以及50多种疾病。云序生物提供系统性环状RNA服务，从筛选（circRNA测序）到验证（qPCR）再到机制研究（RIP、RNA pull-down、ChIP）以及上游表观调控（m6A甲基化等各类RNA修饰研究），覆盖环状RNA上下游分子机制验证的重要研究环节。除了提供组织和细胞的样本类型测序之外，我们还提供体液、血清血浆、外泌体石蜡样本等特殊样本的测序服务。下面就一起回顾一下2020年circRNA的研究成果。

1. 2020 circRNA整体发文情况
我们从PubMed上检索“circRNA”或“circular RNA”，共搜索到2297篇相关研究，相比2019年1767篇的发文总量，2020年增长了近30%。

经统计，2020年circRNA相关研究发表影响因子在10分以上文章有163篇，IF在5~10分的文章有415篇，3~5分有959篇，整体发文质量较高。

汇总2020年发表过circRNA研究的杂志，将发表circRNA文章最多的杂志Top20整理如下（图3）。可以看出哪些杂志发表circRNA论文数目相对较多，可作为发表circRNA研究的热门杂志，为各位投稿提供参考。

同时我们整理了2020年关于circRNA研究我国科学家投稿杂志top20（图4），根据各位前辈的经验，为我们后续参考提供便利。

2. 2020 circRNA研究热词
统计2020发表circRNA研究文章的主题词top10，总结过去一年circRNA的研究热点。发现关键词出现数目最多的除了circRNA，就是biomarker、 miRNA、 proliferation和cancer。由此可见circRNA的几种功能机制的研究中，作为miRNA海绵的相关研究最多，同时从学科领域方面circRNA的研究在疾病相关尤其是增殖与癌 症等研究中更占优势。

3. 部分研究成果
由于circRNA具有组织特异性以及疾病特异性等，不同细胞不同定位的circRNA其功能机制的研究也不同。目前的研究集中在定位于细胞质和细胞核的circRNA，定位于外泌体和其它细胞结构的研究在不断发现。于2020年9月发表在Cell上的一篇题为TargetingMitochondria-Located circRNA SCAR Alleviates NASH via Reducing mROS Output的研究，发现了三个线粒体来源的circRNA在非酒精性脂质性肝炎（NASH）中显著下调。最终确定NASH中hsa_circ_0089762（作者后命名为SCAR）与线粒体ROS释放进而影响病人炎症表征有关。
除了作为miRNA海绵，circRNA与蛋白结合以及circRNA发生RNA修饰的研究也有所上升。在题为N6-methyladenosine-modifiedCircRNA-SOREsustains sorafenib resistance in hepatocellular carcinoma byregulatingβ-catenin signaling研究中发现，circRNA-SORE竞争性地结合miR-103a-2-5p和miR-660-3p，从而激活Wnt/β-连环蛋白途径并促进肝细胞癌（HCC）索拉非尼抗性。在索拉非尼耐药的HCC，circRNA-SORE水平的增加是由于其m6A修饰水平的增加引起的。这些结果揭示了索拉非尼耐药性的一种新机制，并为circRNA-SORE作为晚期HCC患者索拉非尼治疗的一种新药靶点提供了的证明。
对circRNA功能的探索常用正向过表达验证或反向沉默/敲除来验证。通常可用siRNA沉默circRNA，即针对circRNA 的backsplice junction位点前后序列设计siRNA，最 后利用Divergent primer验证circRNA敲除倍数。2020年12月7日，中科院几位教授在NatureMethods发表了一篇重要的circRNA敲除技术文章（Screening for functionalcircular RNAs using the CRISPR-Cas13 system），该文首 次报道利用CRISPR/Cas13实现circRNA的特异性敲低。一些新的circRNA筛查检测和验证的技术方法仍有很大的研究空缺。

以上便是2020 circRNA整体发文情况，高频热点，研究方向及部分重要成果展示的内容。从意外发现到成为科研热宠，我们对circRNA的认识有了巨大飞跃但依然非常有限，不论其产生、表达还是功能，都有着大量的未解之谜。十分期待各位的探索发现之旅。


云序环状RNA课题技术服务四大模块:
一、环状RNA筛选：
1.1 circRNA测序
1.2 全转录组测序（同时检测circRNA、lncRNA、mRNA）
二、环状RNA验证
2.1 qRT-PCR
对选定目标RNA分子可进行qPCR检测服务，包括引物设计与表达鉴定。
2.2 Sanger测序与RNase R酶耐受实验
对选定的环状RNA分子进行反式剪切位点引物设计，扩增后Sanger测序验证环状；使用RNase R酶处理环状RNA分子，验证环状RNA分子稳定性。
三、 CircRNA功能机制研究
3.1 RIP测序/qPCR
针对目标蛋白抗体把蛋白-RNA复合物沉淀下来，并对复合物上的RNA进行测序或对目标RNA进行qRCR表达分析。
3.2 RNA pull-down+MS/WB/qPCR/RNA-Seq
设计目标RNA生物探针把相应的结合蛋白质与RNA复合物沉淀下来，蛋白质谱检测或WB检测与RNA结合的蛋白。设计目标RNA生物探针把相应的结合蛋白质与RNA复合物沉淀下来，qPCR检测或RNA-seq检测与RNA结合的RNA。
3.3 双荧光素酶报告实验
双荧光素酶报告实验检测两个基因之间的互作。
3.4 病毒液以及siRNA设计提供circRNA过表达以及干扰慢病毒，腺病毒以及设计siRNA。
四、CircRNA修饰研究
4.1 m6A/m5C/ac4C/m7G/m1A等修饰
针对环状RNA各类修饰进行高通量筛选。
4.2 MeRIP-circRNA-PCR验证
对高通量测序的结果，通过qPCR进行进一步验证。

云序客户部分环状RNA相关文章

往期环状RNA主题回顾

云序6篇项目文章思路助你环状RNA文章发到手软

2020年环状RNA高分文章怎么发？

Cell Research新玩法：m6A+circRNA玩转17分文章

全转录组测序一箭三雕怎么玩？

环状RNA做ceRNA机制还能发10分以上文章吗？

做了环状RNA，还愁5分文章不好发？丨云序客户最新环状RNA成果揭秘

circRNA再发IF=18.88高分文章--您想知道的circRNA机制研究，都在这儿

云序客户发表首篇直肠癌转移肝癌环状RNA文章，影响因子高达7.8分!

云序手把手教您如何应用RIP和RNA pull down技术——研究RNA分子互作机制冲击高分文章

上海云序生物科技有限公司

Shanghai Cloud-seq Biotech Co., Ltd

地址：上海市松江区莘砖公路518号20号楼3楼

网址：http://www.cloud-seq.com.cn

电话：021-64878766

邮箱：market@cloud-seq.com.cn