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IPA,生物信息分析的首选

作者:上海吉凯基因医学科技股份有限公司 2015-10-28T10:33 (访问量:10690)

您是否还在为自己的实验在开始之初就已经发表而担心?

您是否还在为一大堆的实验数据不知道该从哪里开始而发愁?

您是否还在为拥有一个庞大的实验数据集合而不能获得有效的研究思路而抓狂?


不用担心,IPA来了!IPA的来临,为您带来了最前沿,最清晰,最可靠的生物信息解决方案,为辛勤工作的您创建了崭新的科研视野!


IPA是QIAGEN公司下Ingenuity Pathway Analysis分析平台, 该平台是一个基于后台高度结构化的Ingenuity Knowledge Based的强大数据库。它历经15年的海量投入;拥有500名phD阅读文献;对700种权威杂志全文阅读,3000种杂志摘要阅读,它存储了510万以上的生物实验发现信息,130万种互作信息,3万种以上分子信息;它构建了完整的功能疾病分类数据库,800种信号通路、代谢通路;与公共数据库进行全面合作,并保持每周更新一次。它为众多以发现、创造为己任的科研工作者们提供了及时、准确的生物信息数据。




现在,就让我们以简单的实例来触摸IPA的心跳吧!


当我们获得了一个药物的靶点的时候,我们最希望的是我们可以一目了然的知道这个药物靶标在受到药物后都发生了那些变化,影响了哪些功能,影响这些功能可能是通过哪些分子进行相互影响的。那么IPA就可以帮你解决这个问题。IPA中通过对敲减、过表达、或者药物处理等获得的差异基因一次进行了多个分析,其中包括了经典通络分析,功能与疾病分析,上游调控因子分析,调控效应分析,分析网络分析。

 


举一个简单的例子:
通过IPA对GEO数据的数据进行分析,我们可以知道,目的基因SRF的敲减,对前列腺癌细胞中的癌症功能显著抑制,而细胞生长和增殖,细胞运动,细胞循环等功能被显著激活,在被激活的信号通路EIF2 Signaling中的基因参与了细胞凋亡?,在上游调控分析中我们发现了SRF基因通过调控CXCR4等转录因子影响了细胞侵袭等功能,在调控分析中我们发现了RAF1等基因可以通过ATM等基因抑制了恶性肿瘤的发生,在网络分析中我们找到了目的基因可能通过FAS基因对细胞凋亡产生抑制作用。更多详细信息需要根据不同的实验需求,通过IPA的分析内容进行更为深入的研究。


IPA的作用不仅局限于此,他可以带着我们在基因表达,microRNA,SNP微阵列的数据,代谢物组学和蛋白质组学的实验数据,和一些可产生基因、化学品列表的小规模实验的数据中,搜索到有关基因、蛋白质、化学品和药物的信息,并能够为您创建一个实验系统的交互模型。该软件已被世界顶尖的制药公司和科研机构广泛使用,至今引用该软件发表的高水平科研文献已超过3000篇。


辛勤的科研工作者们都奔走在金光灿烂的星光大道上,您还在等待什么呢?!


现在,吉凯基因可以为您提供全面的IPA分析服务,如果您有意向,快来联系我们吧!







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